GGF. würde ich den Virenschutz deinstallieren. Zudem gibt es für w2k8 R2 keine Downloads, keine Ahnung ob das wichtig ist. Du hast auch alle Steckverbindungen geprüft? USV-Agent ist auch aktuell? Das USV-Kabel ist passend?
Anbei meine Verdachtsliste:
USB-HDD
Symantec
Mainboard
CPU
Die HDD an einem Onboard-RAID zu betrieben ist eher schlecht, die Performance dazu eher sehr mies. Du hast viel Spaß bei einem Mainboard-Tausch.