Hallo RalphT,
ich schließe mich PadawanDeluXe an. Mach dir die Arbeit nicht schwer und nutze ein MDM System (mobile Iron, Cisco Meraki, Sophos, MS Intune). Gängig wäre auch mit RADIUS CoA zu arbeiten. Du lässt die Nutzer erstmal ins Netz, authentifizierst sie dann und gibst ihnen Zugriff auf die Ressourcen die Sie brauchen, sonst nur zum Internet. Bzgl. der Zertifikate könntest du dir auch mal die Enterprise Enrollmentfunktionalitäten der Gerätehersteller anschauen. Apple und Samsung können soweit ich weiß direkt sog. "Betriebsprofile" mitgeben. Ansonsten sprich das doch mal mit einem MDM Experten durch.
Jetzt noch ein Schräger weg zum Zertifikate verteilen: Auf einem Webserver ablegen, den Nutzer Zugangsdaten dazu schicken = Nutzer kann sich das ding per klick am Handy installieren = du hast in der Hand wann du das Teil vom Webserver löscht.
Root Zertifikate sollten eigentlich nicht auf den Geräten sein?!
Grüße Coshi